Speakers

Meet the researchers and scientists at our symposium.

2026

13th RSG-Türkiye Student Symposium

Tunca Doğan

Prof. Dr. · Hacettepe Üniversitesi

Prof. Dr. Tunca Doğan, lisans ve yüksek lisans eğitimini Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi’nde gerçekleştirmiştir. Ardından biyoenformatik alanında araştırmalar gerçekleştirdiği doktora sürecini İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü’nde 2013 yılında tamamlamıştır. Doktora sonrası araştırmalarını İngiltere’de Cambridge Üniversitesi’nde ve Avrupa Biyoenformatik Enstitüsü'nde gerçekleştirmiştir. 2016-2019 yılları arasında ODTÜ Enformatik Enstitüsü’nde araştırma grup lideri ve konuk öğretim üyesi olarak çalışmıştır. 2019 yılında Hacettepe Üniversitesi’nde öğretim üyesi olarak göreve başlayan Dr. Doğan, halen Bilgisayar Mühendisliği Bölümü’nde görev yapmaktadır ve Hacettepe Biyolojik Veri Bilimi Laboratuvarı'nı yönetmektedir. Ekibiyle birlikte, bilim için yapay zeka, biyoenformatik, ve kemoenformatik alanlarında bilimsel araştırmalar gerçekleştirmektedir. Bu kapsamda, geniş çaplı heterojen biyolojik veri entegrasyonu, yeni ilaç adayı moleküllerin keşfedilmesi ve tasarlanması, ve biyomoleküllerin işlevlerinin tahmin edilmesi amaçlarıyla veri bilimi ve derin öğrenme odaklı yöntemler ve araçlar geliştirmekte ve bunları bilim dünyasının kullanımına sunmaktadır. Son üç yıldır yoğun olarak üretken yapay zekâ, temsil öğrenmesi ve dil modelleri üzerinde çalışmaktadır. Bilim Akademisi Genç Bilim İnsanı Ödülü (BAGEP), Türkiye Sağlık Enstitüleri Araştırma Teşvik Ödülü, ODTÜ Parlar Vakfı Araştırma Teşvik Ödülü, Hacettepe Araştırma Teşvik Ödülü ve IBG Bilim Madalyası gibi prestijli bilim ödüllerinin sahibidir.

Atakan Ekiz

Dr. Öğretim Üyesi · İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü (İYTE) Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü’nde öğretim üyesidir. Aynı zamanda Sürdürülebilir Kalkınma İçin Biyoteknoloji ve İnovasyon UNESCO Kürsüsü bünyesinde çalışmalar yürütmektedir. Lisans derecesini İYTE Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü’nde tamamladıktan sonra, doktora çalışmalarını Fulbright bursuyla gittiği University of Utah / Huntsman Cancer Institute Onkolojik Bilimler programında bitirmiştir. Doktora sonrası araştırmalarını aynı üniversitenin Patoloji Departmanı’nda gerçekleştirmiştir. Dr. Ekiz’in araştırmaları; Tümör immünolojisi ve kanser immünoterapisi, Kodlama yapmayan RNA’ların (miRNA, lncRNA) bağışıklık sistemi ve kanserdeki rolleri, Yüksek verili transkriptomik veri analizleri ve açık erişimli biyoinformatik araçların geliştirilmesi (TCGEx, CIPR) üzerine odaklanmaktadır. Araştırma projeleri EMBO Yerleşim Desteği (Installation Grant) ve TÜBİTAK tarafından desteklenen Dr. Ekiz; BAGEP ve TÜBA-GEBİP ödülleri sahibidir.

Melike Dönertaş

Dr. Öğr. Üyesi · Orta Doğu Teknik Üniversitesi

Melike Dönertaş completed her BSc in Molecular Biology and Genetics at Middle East Technical University (METU), and her master's on the computational biology of ageing, also at METU. She did her PhD on ageing and age-related diseases with Prof. Dame Janet Thornton at the University of Cambridge and the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). She continued her postdoctoral research at the Max Planck Institute for Biology of Ageing in Cologne and, as an EMBO Fellow, at the Leibniz Institute on Aging (FLI) in Jena, where she then founded her own research group with the support of the Carl Zeiss Foundation. In 2026 she joined the Department of Health Informatics at METU's Graduate School of Informatics as a faculty member, where she leads the Computational Biology of Ageing group; she continues her work at FLI as an Associate Group Leader. With her group, she studies why ageing happens, how it can be measured and how it might be slowed. Bringing together large-scale human data, multi-omics and machine learning, she follows ageing across scales: from cells losing their identity and the gut microbiome of the short-lived turquoise killifish, to proteomic clocks and the shared genetics of age-related diseases in UK Biobank, and the evolution of ageing. Her work has appeared in leading journals of the field, including Nature Aging, Nature Reviews Genetics, Nature Communications, eLife and Aging Cell, and two of her Nature Aging papers (2021 and 2026) were featured on the journal's cover. She was awarded EMBO and Marie Skłodowska-Curie (MSCA) postdoctoral fellowships, and has been a Principal Investigator in the DFG Collaborative Research Centre "Predictability in Evolution" (CRC 1310) and an Associated PI in the Cluster of Excellence "Balance of the Microverse". She returned to Türkiye with the support of the TÜBİTAK 2232-A International Fellowship for Outstanding Researchers Programme. She chaired RSG-Türkiye in 2017-2018 and the ISCB Global Student Council in 2022.

Burçak Otlu

Dr. Öğr. Üyesi · Orta Doğu Teknik Üniversitesi

ODTÜ Enformatik Enstitüsü Sağlık Bilişimi Bölümü'nde öğretim üyesidir. Lisans, yüksek lisans ve doktora derecelerini ODTÜ Bilgisayar Mühendisliği Bölümü'nde tamamlamıştır. Doktora sonrası araştırmalarını University of California San Diego (UCSD)'de Prof. Dr. Ludmil Alexandrov'un laboratuvarında mutasyon imzaları üzerine gerçekleştirmiştir. Dr. Otlu'nun araştırmaları; Kanser genomiği ve mutasyonel imzalar, Mutasyonel süreçlerin genom topografisi ve epigenomik özelliklerle ilişkisi, Hesaplamalı biyolojide makine öğrenmesi ve derin öğrenme yöntemleri, Açık erişimli biyoinformatik araçların geliştirilmesi (SigProfilerTopography) üzerine odaklanmaktadır. ODTÜ tarafından desteklenen AGEP ve ADEP projelerinin yürütücüsü, Avrupa Birliği tarafından desteklenen EU-DEP SUSA projesinin ise Türkiye yürütücüsüdür.

Gökalp Çelik

Biyoinformatik Müdürü · İntergen Genetik Hastalıklar Tanı Merkezi

2004 yılında Bilkent Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümünden Mezun oldum. 2004 2008 yılları arasında University of Texas Southwestern Medical Center at Dallas 'ta Gelişim biyolojisi ve Genetik üzerine yüksek lisans tamamladım. Ardından sektörde wetlab da farklı alanlarda çalıştıktan sonra 2013 yılında tekrar Türkiye'ye dönüp önce Tübitak MAM Gen Mühendisliği ve Biyoteknoloji Enstitüsünde proje personeli ardından 2015 de Sentegen Biyoteknolojide ARGE personeli ve en son 2017 de İntergen Ankara'da Biyoinformatik uzmanı olarak çalışmalarıma devam ettim. Bu sürede Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsünde Tıbbi Genetik Anabilim Dalında Doktora çalışmalarımı tamamladım. Ayrıca 2023-2025 yılları arasında 2 yıllığına Broad Institute of MIT ve Harvard'da Data Science Platformda GATK takımı içerisinde görev yaptım. 2017 den beri insan genetiği ve nadir hastalıklar üzerine çalışmaktayım ve İntergen ARGE ekibi içerisinde geliştirdiğimiz metodlar ve iş akışları ve özel algoritmalar sayesinde şimdiye kadar 100000'e yakın hastaya hizmet sağladım. Halen İntergen Genetik Hastalıklar Tanı Merkezinde Biyoinformatik Müdürü olarak görev yapmaktayım.

Özlen Konu

Prof. Dr. · Bilkent Üniversitesi

Prof. Dr. Özlen Konu, 2002'den beri Bilkent Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü'nde öğretim üyesidir. Doktorasını Texas Tech Üniversitesi'nde tamamlamış, doktora sonrası çalışmalarını Tennessee Üniversitesi'nde yürütmüştür. Araştırma grubu, kanser hücre sinyalizasyonunu, karaciğer hastalıklarını ve zebra balığı ile memeliler arasında korunmuş yolakları karşılaştırmalı transkriptomik ve sistem biyolojisi yaklaşımlarıyla incelemektedir. Laboratuvarının belirgin özelliklerinden biri, serbestçe erişilebilen biyoinformatik araçlar geliştirmesidir. Bunlar arasında ko-ekspresyon kümelerinin anotasyonu ve önceliklendirilmesi için CAP-RNAseq ile TP53 bağımlılığının meta-analizi için TP53-META yer almaktadır. Ayrıca ilaca bağlı karaciğer hasarıyla ilişkili genetik varyantları haritalayan iDILInet gibi etkileşimli kaynaklara katkı sunmaktadır. Grubu, glioma ve NASH modelleri için zebra balığı ksenogreft ve ilaç tarama platformları da geliştirmekte; kendisi Avrupa'daki ProEuroDILINet ağında yer almaktadır. En son çalışmalarından biri, MASLD'de evreye bağlı moleküler programları ağ tabanlı bir meta-analizle ortaya koymaktadır.

2025

12th RSG-Türkiye Student Symposium

Özkan Özdemir

Researcher

Artificial Intelligence and FAIR Principles in Health. Also workshop instructor for GenNext Variant Filtering.

Ogün Adebali

Researcher

Evolutionary Analysis of Functional Specialization in Protein Families.

Nurcan Tunçbağ

Researcher

Discovery of Hidden Biomolecular Connections in Modeling Complex Diseases.

Vildan Enisoğlu Atalay

Researcher

A New Approach in Drug Design: Computational Chemistry.

Onur Emre Onat

Panel Moderator

Moderator of the panel discussion: Bioinformatics in the Private Sector.

2024

11th RSG-Türkiye Student Symposium

Dr. Mehmet Baysan

Faculty Member, Computer Engineering · Istanbul Technical University / BaysanLab

After obtaining his B.S. from Bilkent University in Computer Science in 2003, Dr. Baysan completed his M.S. and Ph.D. degrees in Computer Science at The University of Texas at Dallas in 2005 and 2008, respectively. In 2010, Dr. Baysan shifted his research focus to computational biology as a post-doctoral fellow at the Neuro-Oncology Branch of the National Cancer Institute (NCI) of the NIH, USA. Following his fellowship, he worked at the NYU Cancer Institute and later at Weill Cornell Medical College as an Associate Research Scientist. He is currently a faculty member in the Computer Engineering Department at Istanbul Technical University. Since 2010, his research has centered on advancing our understanding of disease genomics using computational tools, including COSAP (Comparative NGS Data Analysis Platform) and the Turkey Genome Project.

Prof. Dr. Gökhan Kaçar

Associate Professor, Genetic and Bioengineering · Trakya University

Prof. Dr. Gökhan Kaçar graduated from the Chemical Engineering Department of Boğaziçi University in 2006. He completed his master's degree at Sabancı University's Materials Science and Engineering program in 2009 and pursued his Ph.D. at the Eindhoven University of Technology in the Netherlands between 2009 and 2014. After completing postdoctoral studies at the same institution, he has been a faculty member in the Department of Genetic and Bioengineering at Trakya University since 2015. His research interests include biocompatible polymers, hydrogels, nanoscale drug carrier systems, and molecular-level modeling and simulations of liposomal systems. Dr. Kaçar has 22 internationally indexed publications and 4 TUBITAK projects under his leadership.

Dr. Kübra Narcı

Bioinformatician & Workflows Engineer · GHGA (German Human Genome-Phenome Archive)

Dr. Kübra Narcı holds an M.Sc. and Ph.D. in Bioinformatics from Middle East Technical University in Ankara. She worked as a Bioinformatic Analyst for Seven Bridges Genomics from 2017 to 2022 and has been working as a Bioinformatician and Bioinformatic Workflows Engineer for GHGA since May 2022. She has been a Nextflow Ambassador since December 2023.

Prof. Dr. Handan Ankaralı

Professor, Biostatistics and Medical Informatics · Istanbul Medeniyet University

After completing her master's degree in Biometry and Genetics at Ankara University in 1995, she earned a Ph.D. in the same field in 2000. She achieved the title of Assistant Professor in 2001, Associate Professor in 2006, and Professor in 2011. Currently, she serves as a faculty member at Istanbul Medeniyet University, Faculty of Medicine, in the Department of Biostatistics and Medical Informatics. She has authored over 500 scientific articles and five books. Her main areas of expertise include Biostatistics, Informatics, Data Science, Data Mining, and Population Genetics.

Assoc. Prof. Dr. Abdülkadir Koçak

Associate Professor

2023

10th RSG-Türkiye Student Symposium

Dr. Ramazan Terzi

Associate Professor, Computer Engineering · Erciyes University

Dr. Ramazan Terzi completed his undergraduate and master's degree studies in Computer Engineering at Erciyes University. He holds a PhD degree in Computer Engineering from Gazi University. He is currently working as an Associate Professor in the Computer Engineering Department at Erciyes University. His research interests focus on data mining, machine learning, and big data analytics in biomedical applications.

Prof. Dr. Tolga Çukur

Professor, Electrical and Electronics Engineering · Bilkent University

After receiving his bachelor's degree from Bilkent University in 2003 and his PhD from Stanford University in 2009, he continued his postdoctoral studies at the University of California, Berkeley. He is currently a Professor in the Electrical and Electronics Engineering Department at Bilkent University. His research focuses on computational imaging and machine learning in the context of MRI and neuroscience.

Prof. Dr. Kaan Orhan

Professor, Dentomaxillofacial Radiology · Ankara University

Dr. Burçak Otlu

Postdoctoral Researcher · UC San Diego

Dr. Ahmet Görkem Er

Researcher